Esta línea pretende contribuir desde la ecología al desarrollo de protocolos generalizables para la restauración de los ecosistemas afectados por las actividades humanas, con énfasis en la recuperación de sus características funcionales y su biodiversidad. Se colabora con diversas empresas o bien generadoras de problemas ambientales y preocupadas en su seguimiento y resolución (e.g. constructoras del Grupo Ferrovial-Agroman SA) o bien interesadas en la mejora de la reforestación con especies autóctonas (e.g. TRAGSA) o en la producción en vivero de especies autóctonas poco conocidas o difíciles (e.g. viveros Barbol). Los principales temas de investigación son: